Posted by on 13 lipca 2018

Obliczyliśmy wartość od 0 do 2 dla każdego SNP dla każdej osoby na podstawie sumy prawdopodobieństw tylnych dla allelu zwiększającego wysokość i pomnożonego przez wielkość efektu obserwowaną dla wysokości. Następnie sumowaliśmy te wartości dla wszystkich SNP dla każdej osoby, a poszczególne osoby były następnie grupowane w kwartyle. Zastosowaliśmy regresję logistyczną, aby oszacować kwartyle po dostosowaniu do badania, aby oszacować łączne współczynniki szans dla CAD. Aby ocenić związek pomiędzy wariantami wysokości a czynnikami ryzyka sercowo-naczyniowego, połączyliśmy oszacowania ?3 za pomocą metaanalizy o stałym efekcie, z wyjątkiem przypadków, w których heterogeniczność była wysoka (I2,> 40%), w którym to przypadku wykonaliśmy losowe metaanaliza efektów. W przypadku tych analiz wartości ?3 odzwierciedlają zmianę jednostki miary zmiennej na 1-SD zmianę wysokości dla zmiennych ilościowych (z wartością ujemną odzw ierciedlającą odwrotne powiązanie) lub iloraz szans dla zmiennych jakościowych. Ponieważ przetestowaliśmy łącznie 13 cech (w tym CAD), wzięliśmy pod uwagę wartość P wynoszącą 0,003 dla wskazania istotności statystycznej (Tabela 1).
Aby zidentyfikować typowe procesy biologiczne, które mogłyby wyjaśnić związek między wysokością a CAD, przeprowadziliśmy analizę ścieżki za pomocą oprogramowania Ingenuity Pathway Analysis (IPA), wersja 18488943 (Ingenuity Systems). Taka analiza wymaga przypisania każdego związanego z wysokością SNP do określonego genu, który następnie włącza się do analizy szlaku. (Dalsze szczegóły dotyczące procesu selekcji genów znajdują się w dodatkowym dodatku, pełna lista genów uwzględnionych w analizie znajduje się w tabeli S4 w dodatkowym dodatku). Wynik IPA obejmuje wartości Benjamini-Hochberg Q dla współczynnik fałszywych odkryć.18
Wyniki
Przypadki badań i kontrole
Maksymalna lic zba przypadków CAD i kontroli dostępnych do analizy wyniosła odpowiednio 65 066 i 128 383 (tabela S1 w dodatkowym dodatku); 73,8% przypadków i 49,8% kontroli stanowili mężczyźni. Średni wiek wynosił 57,3 lat (zakres od 42,4 do 75,6), a 65% przypadków zgłaszało przebytą zawał mięśnia sercowego.
Oparte na wysokościach warianty i CAD
Rysunek 1. Rysunek 1. Wykres lasu wykazujący wpływ wysokości na ryzyko choroby wieńcowej (CAD) dla każdego powiązanego z genotypem wariantu genetycznego. Przedstawiono iloraz szans dla każdego związanego z wysokością polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP) dla ?3 wartości (tj. domniemane powiązanie między wzrostem a CAD za pośrednictwem tego wariantu). Podano liczbę przypadków i kontroli, które analizowano dla każdego wariantu. Współczynniki prawdopodobieństwa ?3 są uporządkowane w rosnących wartościach na dwóch panelach w celu ułatwienia wizualizacji [więcej w: nutraceutyki, Dmuchawy bocznokanałowe, laserowe obkurczanie pochwy ]

Powiązane tematy z artykułem: Dmuchawy bocznokanałowe laserowe obkurczanie pochwy nutraceutyki

Posted by on 13 lipca 2018

Obliczyliśmy wartość od 0 do 2 dla każdego SNP dla każdej osoby na podstawie sumy prawdopodobieństw tylnych dla allelu zwiększającego wysokość i pomnożonego przez wielkość efektu obserwowaną dla wysokości. Następnie sumowaliśmy te wartości dla wszystkich SNP dla każdej osoby, a poszczególne osoby były następnie grupowane w kwartyle. Zastosowaliśmy regresję logistyczną, aby oszacować kwartyle po dostosowaniu do badania, aby oszacować łączne współczynniki szans dla CAD. Aby ocenić związek pomiędzy wariantami wysokości a czynnikami ryzyka sercowo-naczyniowego, połączyliśmy oszacowania ?3 za pomocą metaanalizy o stałym efekcie, z wyjątkiem przypadków, w których heterogeniczność była wysoka (I2,> 40%), w którym to przypadku wykonaliśmy losowe metaanaliza efektów. W przypadku tych analiz wartości ?3 odzwierciedlają zmianę jednostki miary zmiennej na 1-SD zmianę wysokości dla zmiennych ilościowych (z wartością ujemną odzw ierciedlającą odwrotne powiązanie) lub iloraz szans dla zmiennych jakościowych. Ponieważ przetestowaliśmy łącznie 13 cech (w tym CAD), wzięliśmy pod uwagę wartość P wynoszącą 0,003 dla wskazania istotności statystycznej (Tabela 1).
Aby zidentyfikować typowe procesy biologiczne, które mogłyby wyjaśnić związek między wysokością a CAD, przeprowadziliśmy analizę ścieżki za pomocą oprogramowania Ingenuity Pathway Analysis (IPA), wersja 18488943 (Ingenuity Systems). Taka analiza wymaga przypisania każdego związanego z wysokością SNP do określonego genu, który następnie włącza się do analizy szlaku. (Dalsze szczegóły dotyczące procesu selekcji genów znajdują się w dodatkowym dodatku, pełna lista genów uwzględnionych w analizie znajduje się w tabeli S4 w dodatkowym dodatku). Wynik IPA obejmuje wartości Benjamini-Hochberg Q dla współczynnik fałszywych odkryć.18
Wyniki
Przypadki badań i kontrole
Maksymalna lic zba przypadków CAD i kontroli dostępnych do analizy wyniosła odpowiednio 65 066 i 128 383 (tabela S1 w dodatkowym dodatku); 73,8% przypadków i 49,8% kontroli stanowili mężczyźni. Średni wiek wynosił 57,3 lat (zakres od 42,4 do 75,6), a 65% przypadków zgłaszało przebytą zawał mięśnia sercowego.
Oparte na wysokościach warianty i CAD
Rysunek 1. Rysunek 1. Wykres lasu wykazujący wpływ wysokości na ryzyko choroby wieńcowej (CAD) dla każdego powiązanego z genotypem wariantu genetycznego. Przedstawiono iloraz szans dla każdego związanego z wysokością polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP) dla ?3 wartości (tj. domniemane powiązanie między wzrostem a CAD za pośrednictwem tego wariantu). Podano liczbę przypadków i kontroli, które analizowano dla każdego wariantu. Współczynniki prawdopodobieństwa ?3 są uporządkowane w rosnących wartościach na dwóch panelach w celu ułatwienia wizualizacji [więcej w: nutraceutyki, Dmuchawy bocznokanałowe, laserowe obkurczanie pochwy ]

Powiązane tematy z artykułem: Dmuchawy bocznokanałowe laserowe obkurczanie pochwy nutraceutyki